Explicação

Em algum momento pode ser necessário que o ALUNO A, curse as disciplinas A, B e C na TURMA A, e que este mesmo ALUNO A curse a discipina D na TURMA B. Ou seja, o aluno precisará estar cursando em 2 tumas diferentes, sendo que em cada turma ele deve ter acesso a determinadas disciplinas para lançamento de notas, etc. Então precisamos ocultar a disciplina D na TURMA A, e ocultar as disciplinas A, B e C na TURMA B.

Pré-requisito

Antes de iniciar esse procedimento, é preciso que o aluno já esteja com situação CURSANDO em ambas as turmas.
Siga este manual: http://manual.sistemasiga.net/2016/12/08/como-remanejar-alunos/
E no item 3 do manual acima, escolha a opção: "Manter nas duas turmas e adiciona-lo a esta", para que o aluno esteja nas duas turmas.
 

Passo a passo

1. Clique no menu lateral "Turmas", depois clique em "Gestão de turmas" 
2. Busque/Encontre a turma desejada na lista
3. Clique no ícone da coluna "Alunos"
4. Na tela que abriu, clique no ícone da coluna "Configurações" do aluno desejado
5. Na tela que abriu escolha quais disciplinas você deseja OCULTAR para o aluno na turma em questão, e escolha também os locais para ocultar as disciplinas selecionadas
6. Clique no botão azul SALVAR, e feche a jenela
7. Pronto, faça o mesmo procedimento na outra turma onde o aluno está, ocultando as disciplinas desejadas
8. Para testar, simule o lançamento de notas e obserse se o aluno desejado está sendo ocultado no lançamento de notas, e se selecionado faça a geração de boletim e observe no boletim se as disciplinas selecionadas estão sendo ocultadas na turma correta.